alphafold3蛋白质和DNA相互作用（一）8ilw 双链 json模板-北极星高性能计算平台

alphafold3安装和使用

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信息来源：发布日期：2024-11-22

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从https://www.rcsb.org/fasta/entry/6JVX /display获取fasta文件，生成以下json，提交任务，其他参考，蛋白质和小分子的步骤

(AF3) [chenfj@s61b04n01 testaf3]$ cat 8ilw.json

{

"name":"8ILW",

"modelSeeds": [1,22,333,4444,66666],

"sequences": [

{"protein": {

"id":"A",

"sequence":"KRPRTILTTQQRRAFKASFEVSSKPCRKVRETLAAETGLSVRVVQVWFQNQRAKMKKLAR"

}

{

"dna": {

"id":"B",

"sequence":"CAACACTTAATCCAAA"

}

{

"dna": {

"id":"C",

"sequence":"GTTTGGATTAAGTGTT"

}

"dialect":"alphafold3",

"version":1

}

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