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Anaconda3(一):安装,指定源,北极星源,指定路径安装

信息来源: 发布日期:2022-11-22

Anaconda3:安装,指定源,北极星源,指定路径安装,加速

一,安装:

1、下载(北极星集群):

lustre1在各个分区都有挂载,可以在这个分区上安装软件,创建自己软件的安装目录,比如您叫高贵贵,导师是高规,那么就在lustre1上创建一个gaog文件夹

cd ~

mkdir lustre1/gaogg ###这一步出错,请联系下管理员。或者直接指定绝对路径: mkdir -p /lustre1/gaog/gaogg/apps/ 下同

mkdir lustre1/gaogg/apps/

mkdir lustre1/gaogg/apps/tar

mkdir lustre1/gaogg/apps/source

cd lustre1/gaog/apps/tar

或者:主账号

mkdir /lustre1/${USER}/apps

mkdir /lustre1/${USER}/tar

mkdir /lustre1/${USER}/source

cd /lustre1/${USER}/tar

或者子账号

mkdir /lustre1/`group`/${USER}/apps

mkdir /lustre1/`group`/${USER}/tar

mkdir /lustre1/`group`/${USER}/source

cd /lustre1/`group`/${USER}/tar

教学集群没有子账号,将/lustre1变为/gpfs1:

mkdir /gpfs1/${USER}/apps

mkdir /gpfs1/${USER}/tar

mkdir /gpfs1/${USER}/source

cd /gpfs1/${USER}/tar

下面相同,看是什么账号

wget https://repo.anaconda.com/archive/Anaconda3-2022.05-Linux-x86_64.sh

2、安装:

1) 默认安装 sh Anaconda3-2022.05-Linux-x86_64.sh

切记:在多用户或者多个conda环境下,不要选择yes

我们最好养成一个好习惯,用source或者module去使用不同软件,尽量不写入bashrc里。比如这个教程,如果是写入bashrc里使用起来不方便,有时候会混乱。(参考编译程序六)

图片关键词

安装完后

cp /lustre1/gaog/gaogg/apps/Anaconda3/bin/activate /lustre1/gaog/gaogg/source/Anaconda3.sh

启用:

source /lustre1/gaog/gaogg/source/Anaconda3.sh

2) 自定义安装(推荐)

sh Anaconda3-2022.05-Linux-x86_64.sh -b -p /lustre1/gaog/gaogg/apps/Anaconda3

安装完后

cp /lustre1/gaog/gaogg/apps/Anaconda3/bin/activate /lustre1/gaog/gaogg/source/Anaconda3.sh

启用:

source /lustre1/gaog/gaogg/source/Anaconda3.sh

3)教学集群安装:

sh Anaconda3-2022.05-Linux-x86_64.sh -b -p /gpfs1/${USER}/apps/Anaconda3

cp /gpfs1/${USER}/apps/Anaconda3/bin/activate /gpfs1/${USER}/source/Anaconda3.sh

3、指定源

1)清华源:

cat ~/.condarc ##:

channels:

- defaults

show_channel_urls: true

default_channels:

- http://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/main

- http://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/r

- http://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/msys2

custom_channels:

conda-forge: http://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud

msys2: http://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud

bioconda: http://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud

menpo: http://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud

pytorch: http://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud

pytorch-lts: http://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud

simpleitk:http://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud

在北极星集群的使用方法:

cat /appsnew/source/conda.tsu > ~/.condarc

conda clean -i

就可以使用了

2)豆瓣源:

cat ~/.condarc ##:

channels:

- https://pypi.douban.com/anaconda/cloud/pytorch/

- https://pypi.douban.com/anaconda/cloud/menpo/

- https://pypi.douban.com/anaconda/cloud/bioconda/

- https://pypi.douban.com/anaconda/cloud/msys2/

- https://pypi.douban.com/anaconda/cloud/conda-forge/

- defaults

在北极星集群的使用方法:

cat /appsnew/source/conda.douban > ~/.condarc

conda clean -i

3)北外源:

cat ~/.condarc ##:

channels:

- defaults

show_channel_urls: true

default_channels:

- https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/pkgs/main

- https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/pkgs/r

- https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/pkgs/msys2

custom_channels:

conda-forge: https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/cloud

msys2: https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/cloud

bioconda: https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/cloud

menpo: https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/cloud

pytorch: https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/cloud

pytorch-lts: https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/cloud

simpleitk: https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/cloud

channels:

- https://pypi.douban.com/anaconda/cloud/pytorch/

- https://pypi.douban.com/anaconda/cloud/menpo/

- https://pypi.douban.com/anaconda/cloud/bioconda/

- https://pypi.douban.com/anaconda/cloud/msys2/

- https://pypi.douban.com/anaconda/cloud/conda-forge/

- defaults

在北极星集群的使用方法:

cat /appsnew/source/conda.bfsu > .condarc

conda clean -i

4) 本地源-北极星源

cat .condarc

channels:

- http://162.105.160.16:808/yum/pku/pkgs/main/

- http://162.105.160.16:808/yum/pku/pkgs/free/

- http://162.105.160.16:808/yum/pku/pkgs/cloud/bioconda/

- http://162.105.160.16:808/yum/pku/pkgs/r/

show_channel_urls: true

在北极星集群的使用方法:

cat /appsnew/source/conda.bjx >~/.condarc

conda clean -i

5)使用和恢复默认源

rm -rf ~/.condarc

conda clean -i

查看配置信息

conda config --show

恢复默认源

conda config --remove-key channels

4、windows下设置北极星源

conda config --add channelshttp://162.105.160.16:808/yum/pku/pkgs/main/

conda config --add channelshttp://162.105.160.16:808/yum/pku/pkgs/cloud/bioconda/

conda config --add channels http://162.105.160.16:808/yum/pku/pkgs/r/

conda config --add channels http://162.105.160.16:808/yum/pku/pkgs/free/