Anaconda3(四)windows下的安装;autodock、autodock vina、pymol安装pymol
一、window下的安装
下载网址
miniconda官网:https://conda.io/miniconda.html
https://repo.anaconda.com/miniconda/Miniconda3-latest-Windows-x86_64.exe
下载后按照提示安装(暂停360等软件30分钟)
安装后点击这里
二、启动、创建虚拟环境,配置虚拟bioconda环境(linux同)
windows点击上图
linux 在北极星集群或者教学集群 source
conda create -n ad_chenfj python=3.9## 安装到 ~/.conda/envs 下
conda activate ad_chenfj ###激活虚拟环境
三、windows 安装
pymol 支持windows
conda install -c schrodinger pymol
https://zhuanlan.zhihu.com/p/505447035
四、Linux安装
autodock vina 仅仅在linux 下 和mac:
1、 source /appsnew/source/Anaconda3-2022.05-local.sh
2 、conda create -n ad_chenfj python=3.9 ##创建自己的虚拟环境 ad_chenfj
3、conda activate ad_chenfj
pymol安装:
conda install -c schrodinger pymol ###linux 不支持开源,自己注册
autodock-vina安装:
conda install -c bioconda autodock-vina
conda install -c bioconda autodock
安装好了:
(ad_chenfj) which vina
~/.conda/envs/ad_chenfj/bin/vina
(ad_chenfj) which autodock4
~/.conda/envs/ad_chenfj/bin/autodock4
conda deactivate ad_chenfj ##退出