Anaconda3（三）：conda安装提速：mamba； mamba和bioconda
mamba：
1、相比于 conda，mamba 是用 c++重写了 conda 的部分功能，运行效率显著提高，可以进行并行的下载，使用 rpm 包管理工具中的 libsolv，可以更快的解决环境依赖问题。
mamba 的使用也比较简单，首先使用 conda 安装 mamba，后面所有用到 conda 的地方，都可以使用 mamba 替换即可。
2、北极星源使用方法
cat /appsnew/source/conda.bjx >~/.condarc ;conda clean -i
conda install -y curl ### 这个必须先安装
conda install -c conda-forge -y mamba #(注意：北极星源不含conda-forge这部分)
mamba install -c bioconda -y bwa
mamba install -c bioconda -y satools
为 mamba 设置别名 alias 'conda= mamba'
3、非北极星源的使用方法，比如清华：
cat /appsnew/source/conda.tsu >~/.condarc ;conda clean -i
conda install -y curl ### 这个必须先安装
conda install -c conda-forge -y mamba
mamba install -c bioconda -y bwa
使用 bioconda 安装常用软件
mamba install -c bioconda -y bwa
mamba install -c bioconda -y samtools
mamba install -c bioconda -y blast
mamba install -c bioconda -y blat
mamba install -c bioconda -y bcftools ### 必须先安装curl 否则这里会先安装旧版本的
mamba install -c bioconda -y mummer
mamba install -c bioconda -y mafft
mamba install -c bioconda -y muscle
mamba install -c bioconda -y lastz
mamba install -c bioconda -y sratools ##貌似没有了
mamba install -c bioconda -y seqkit
mamba install -c bioconda -y seqtk
mamba install -c bioconda -y bedtools
mamba install -c bioconda -y bedops
mamba install -c bioconda -y gfatools
mamba install -c bioconda -y circos
mamba install -c bioconda -y entrez-direct
mamba install -c bioconda -y emboss
安装数据质控软件
mamba install -c bioconda -y fastqc multiqc
mamba install -c bioconda -y trimmomatic
mamba install -c bioconda -y fastp
mamba create -n nanoplot -y nanoplot
安装基因组拼接相关工具
mamba install -c bioconda -y velvet
mamba install -c bioconda -y flye
mamba install -c bioconda -y miniasm
mamba install -c bioconda -y canu
mamba install -c bioconda -y megahit
mamba install -c bioconda -y spades
mamba install -c bioconda -y quast
mamba install -c bioconda -y racon
mamba install -c bioconda -y miniasm
mamba install -c bioconda -y nanopolish
安装基因功能分析软件
mamba install -c bioconda -y prodigal
mamba install -c bioconda -y glimmer
mamba install -c bioconda -y augustus
mamba install -c bioconda -y trf
报错：
mamba install -c bioconda -y bcftools #，会报错，其他没有问题
因为：
curl 7.26.0 太老了
报错为： curl_url_cleanup
conda 提示符消失怎么弄：
https://zhuanlan.zhihu.com/p/572716915