四、在singularity安装举例：使用yum安装自己的gcc8（二）

四、安装高版本的GCC

1、在singularity使用yum安装高版本的gcc需要本地系统，所以需要进入本地系统安装，如果不涉及安装内核的内容，可以不用本地系统

我们在login05，login06，login07，login12均安装了本地系统，直接执行这个命令就可以进入

cd ~/docker

或者：

cd /docker/dockerpath/`groups |awk '{print $1}'`

2、拉取centos，推荐使用北极星集群，比较快，在login06上执行

singularitybuild --no-https  --sandbox gcc8 docker://bjxdockerfast:5000/centos7.6_bjx:latest

或者其他登陆节点：

singularitybuild --no-https  --sandbox gcc8 docker://bjxdocker:5000/centos7.6_bjx:latest

或者从官网上获取：

singularitybuild  --sandbox gcc8  docker://centos:7.6.1810

查看tags https://hub.docker.com/_/centos/tags

3、创建文件夹和加载文件，这个是方便将来在北极星集群使用软件，也可以不创建

mkdir gcc8/appsnew

4、进入系统安装相关软件，以虚拟root的身份进入的

singularityshell -B /appsnew -w   gcc8

Apptainer>yum install -y gcc gcc-c++ gcc-gfortran readline-devel bzip2-devel libXt-devel fonts-chinese tcl tcl-devel tclx tk tk-devel

Apptainer>yum install -y mesa-libGLU mesa-libGLU-devel libcurl libcurl-devel xz-devel.x86_64 pcre2-devel libicu wget  which perl libgfortran5

Apptainer>yum install epel-release centos-release-scl  -y

Apptainer>yum install devtoolset-8  -y

Apptainer>source /opt/rh/devtoolset-8/enable

Apptainer>echo "source /opt/rh/devtoolset-8/enable" >> /environment

Apptainer>gcc -v

 5、退出后，打包或者直接挪走

因为本地docker有配额限制，请安装完打包删除，或者直接挪走

见前面打包的内容，为标题：三

Apptainer>exit

singularitybuild gcc8.sif gcc8

singularityexec  gcc8.sif gcc -v

很小： 291M Dec  7 21:34 gcc8.sif

6、删除

删除前需要给文件夹写的权限，否则会报错

chmod -R a+w gcc8

rm -rf gcc8