(二)、singularity中使用mpi--amber,自己编译amber(含cuda)1、在login06上执行singularitybuild --sandbox centos7.6_bjxenv_0 docker://bjxdockerfast:5000/centos7.6_bjxenv_0 其他登陆节点:singularitybuild --sandbox centos7.6_
2022-12-06 admin 103
一、dconf:恢复桌面环境的默认设置dconf reset -f /就可以恢复原先得默认设置二、编辑-图形界面下dconf-editor
2023-09-14 admin 0
一、命令格式RFAA.run [–pymol] [pdb|fasta] [small.pdb|small.mol2]格式说明3、 跑小分子mol2格式 : RFAA.run 1tce.pdb XG4.mol2 RFAA.run input.fasta XG4.mol24、 跑小分子pdb格式 : RFAA.run 1tc
2024-04-12 admin 0
在图形终端同时打开Firefox会出现如下错误:Firefox is already running, but is not responding. To open a new window,you must first close the existing Firefox process, or restart your system.解决方法:一、在图形终端打开终端右键点击空白处,弹出对话框二
2023-09-14 admin 0
六、singularity中使用之GPU--amber的cuda的北极星版本使用和使用容器编译的amber的cuda版本(一)(一)amber的cuda的北极星版本使用1、使用五(二)部分的镜像,ambermd使用北极星amber配置 vi ambermd/environment#!/bin/sh# Copyright (c) Contributors to the Apptainer proj
2022-12-10 admin 201
1、搜索dockersearch tensorflow2、下载镜像推荐使用北极星dockerserver集群,比较快,在login06上执行,文件差不多6GBsingularitybuild --no-https --sandbox tensorflow_gpu docker://bjxdockerfast:5000/tensorflow_gpu:latest或者其他登陆节点:singulari
2022-12-09 admin 184
一、提交案例- 8IT4+小分子案例路径:/gpfs3/database/RFAA/alian1、获取小分子8IT4small.pdb:参考小分子非共价作用 方法一,打开https://files.rcsb.org/view/8IT4.pdb拖到最后,找到小分子内容复制并保存小分子文件8IT4small.pdb方法二:使用pymol提取 2、生成初始yaml文件执行命令:RFAA.run 8IT4
2024-04-11 admin 0