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![四、在singularity安装举例：使用yum安装自己的gcc8（二）]()
四、在singularity安装举例：使用yum安装自己的gcc8（二）
四、安装高版本的GCC1、在singularity使用yum安装高版本的gcc需要本地系统，所以需要进入本地系统安装，如果不涉及安装内核的内容，可以不用本地系统我们在login05，login06，login07，login12均安装了本地系统，直接执行这个命令就可以进入cd ~/docker或者：cd /docker/dockerpath/`groups |awk '{print $1}
2022-12-07 admin 402
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![四、在singularity安装举例：在北极星集群里运行centos8.4（python3）以及ubuntu（三）]()
四、在singularity安装举例：在北极星集群里运行centos8.4（python3）以及ubuntu（三）
这里我们以centos8.4为例子，这个版本python2已经换成python31、搜索dockersearch centos82、获取高版本的centos，如果涉及修改内核等，需要进入本地系统，参考（二）推荐使用北极星集群，比较快，在login06上执行singularitybuild --no-https --sandbox centos8.4 docker://bjxdockerfast:
2022-12-08 admin 94
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![六、全屏操作和设置分辨率]()
六、全屏操作和设置分辨率
xfce界面如下图设定，login24/25/26/28/29：1、设置全屏，以谷歌浏览器为例，按F11快捷键也可以。再按一次退出2、设置分辨率以全屏显示，自己选择选项mate界面login27/301、设置全屏，以谷歌浏览器为例，见xfce ，按F11快捷键也可以。再按一次退出2、设置分辨率以全屏显示
2023-05-05 admin 20
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![三、在北极星集群上提交RoseTTAFold-All-Atom------核酸序列]()
三、在北极星集群上提交RoseTTAFold-All-Atom------核酸序列
一、fasta格式，必须按照标准来定义：1、核酸和蛋白的fasta格式：8IK4_org.fasta：>8IK4_1|Chains A, B|Type IV methyl-directed restriction enzyme EcoKMcrB subunit|Escherichia coli K-12 (83333)MESIQPWIEKFIKQAQQQRSQSTKDYPTSYRNLRVKL
2024-04-13 admin 0
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![五、singularity之MPI--在容器中使用amber的mpi（一）]()
五、singularity之MPI--在容器中使用amber的mpi（一）
MPI是一个跨语言的通讯协议，用于编写并行计算，主要是跨节点并行（一）、singularity中使用mpi--amber，使用北极星环境中的amber1、在 /lustre1等并行文件系统执行一下命令，在login06上执行singularitybuild --sandbox centos7.6_bjxenv_0 docker://bjxdockerfast:5000/centos7.6_
2022-12-05 admin 109
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![alphafold3蛋白质和DNA相互作用（一）8ilw 双链 json模板]()
alphafold3蛋白质和DNA相互作用（一）8ilw 双链 json模板
从https://www.rcsb.org/fasta/entry/6JVX /display获取fasta文件，生成以下json，提交任务，其他参考，蛋白质和小分子的步骤(AF3) [chenfj@s61b04n01 testaf3]$ cat 8ilw.json { "name": "8ILW", "modelSeeds": [1
2024-11-22 admin 0
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![七、苹果键盘设置]()
